Sedangkan untuk jadwal kereta api Malabar kedua diberangkatkan 22.56 WIB dari Stasiun Yogyakarta dan akan tiba di Stasiun Bandung pada pukul 06.06 WIB dengan durasi perjalanan 7 jam 10 menit.

Sejumlah kelas dan harga yang ditawarkan KA Malabar dengan rute Stasiun Yogyakarta-Bandung sebagai berikut:

- KA Malabar kelas ekonomi (S) Rp 225.000

- KA Malabar kelas eksekutif (J) Rp 395.000

- KA Malabar kelas ekonomi (P) Rp 225.000

- KA Malabar kelas ekonomi (C) Rp 235.000

- KA Malabar kelas ekonomi (CA) Rp 240.000

- KA Malabar kelas ekonomi (CB) Rp 250.000

- KA Malabar kelas ekonomi (CC) Rp 255.000

- KA Malabar kelas eksekutif (H) Rp 395.000

- KA Malabar kelas eksekutif (A) Rp 425.000

- KA Malabar kelas eksekutif (AA) Rp 440.000

- KA Malabar kelas eksekutif (AB) Rp 460.000

- KA Malabar kelas eksekutif (AC) Rp 465.000

3. KA Argo Wilis